Gentypisierung

Frage

Ich bin 68 Jahre alt und habe CF. Mein Bruder, der ebenfalls CF hatte, starb 1985 im Alter von 38 Jahren.
In meinem Gen-Test erscheint folgendes Ergebnis:
F508del/normal;7T/9T
Gentyp in HGVS: c.(1521_1523delCTT;) (=)
Referenz Sequenz: NM_000492.3
und niemand kann mir genau erklären, was das bedeutet. Können Sie mir helfen?
Ich danke Ihnen im Voraus für Ihre Zeit.
Liebe Grüße
I.

Antwort

Liebe Fragende,

zunächst: bei meiner Antwort gehe ich davon aus, dass Ihre Diagnose "CF" klinisch zweifelsfrei durch einen Mukoviszidose-erfahrenen Facharzt gesichert ist. Dann liest sich der humangenetische Befund so:

1. Mukoviszidosepatienten tragen zwei krankheitsauslösende CFTR-Gene (eins vom Vater, eins von der Mutter geerbt). Bei Ihnen wurde eine krankheitsauslösende Variante gefunden, die heißt F508del-CFTR (anderer Name dafür ist: c.(1521_1523delCTT)).

2. die Abkürzungen bedeuten, dass von den 1480 Eiweißbausteinen des CFTR-Proteins der 508te fehlt (das wäre ein Phenylalanin-Baustein, abgekürzt F, gewesen). c1521-1523 ist die Beschreibung auf der Ebene der Boten-RNA, aus der das CFTR-Eiweiss gebaut wird: dort fehlen drei Bausteine, C, T und T (stehen für Cytosin, Thymidin, Thymidin). Das daraus hervorgehende CFTR-Eiweiß funktioniert nicht richtig und löst Mukoviszidose aus, wenn auf dem anderen CFTR-Gen ebenfalls eine krankheitsauslösende Mutation vorliegt.

3. Die andere krankheitsauslösende CFTR-Variante konnte der Humangenetiker bei Ihnen nicht finden - aber es gibt viele seltene krankheitsauslösende CFTR-Varianten, davon wird nur ein kleiner Teil (die häufigen) routinemäßig getestet.

4. 7T/9T ist nicht Mukoviszidose-auslösend: hier handelt es sich um eine Sequenz von 5, 7 oder 9 T-Bausteinen der prä-mRNA, aus der die Boten-RNA hervorgeht. 5T sind, salopp formuliert, schlecht, aber 7T und 9T lösen keine Mukoviszidose aus.

Zusammenfasend tragen Sie (erneut: klinisch zweifelsfrei durch einen Mukoviszidose-erfahrenen Facharzt diagnostizierte CF-Patientin) einen sogenannten unaufgeklärten Mutationsgenotyp.

Mit den besten Wünschen,
Frauke Stanke

17.09.2017

Die Antwort wurde erstellt von: Dr. Frauke Stanke